繼司法院推出「司法改革藍皮書」後，法務部於1999年3月31日提出「檢察改革白皮書」，不過檢察官改革協會左批司法院太過「蠻橫」，右轟法務部的白皮書「換湯不換藥」。檢改會發言人表示，司法院版本的司法⋯⋯

針對司法院擬具刑事訴訟制度改採當事人進行主義等司法改革藍圖，法務部於1999年3月31日也提出不同意見，認為刑事訴訟制度不應以當事人進行主義或職權進行主義的二分法來討論，應採加強檢察官舉證責任並維⋯⋯

針對司法院所提司法藍圖，規劃我國刑事訴訟將朝「當事人進行主義」方向修正，部分檢察官私下表示無法苟同，並強調外國的訴訟不能照單全收，應有相關配套措施，否則改革將不會成功。司法院提出司改藍圖及時間表後⋯⋯

司法院與法務部近日分別推出自己的司法改革書，司法院秘書長楊仁壽於1999年3月31日在立法院司法委員會公開表示，對於檢察官所反彈的起訴狀一本主義，楊仁壽表示若過關「願回地檢署當檢察官」。目前司法院⋯⋯

1999年3月31日法務部提出首部檢察改革白皮書，法務部長葉金鳳表示，法務部將勇於面對司法改革，但司法改革必須要有配套，不能莽撞、不能有想像空間。由於法務部的改革方案與司法院目前提出的司改藍皮書有⋯⋯

1999年3月31日司法院秘書長楊仁壽在立法院司法委員會答詢時承諾，司法院的改革藍圖將盡全力進行，預計四年內將台灣建設成一個現代法治國家，未來司法院打算將檢察官在法庭的席位調整到與被告對等，這是基⋯⋯

司法院及法務部相繼公布不同的司法改革方案，檢察官改革協會於1999年3月31日表示，白皮書在維護檢察權公正行使的努力，要成立檢察官會議、研修法官法草案等值得肯定，但認為兩分計畫書內容均不夠具體周延⋯⋯

1999年3月31日法務部推出「檢察改革白皮書」，強調以「人民的司法」為改革主軸，提出維護檢查權之公正行使等八項檢查改革方向，包含維護檢查權之公正行使、持續打擊犯罪之成效、充實檢察機關的辦案資源、⋯⋯

司法院公布司法改革藍圖，立即引發法務部系統的反彈，究竟是司法院版本還是法務部的檢察改革白皮書行的通，見仁見智，兩者皆為司法機關，應該是緊密的合作關係，司法院身為最高司法行政機關，理當扛起司法改革的⋯⋯

司法院於1999年3月30日提出的司法改革藍皮書政策，3月31日立刻遭到法務部強烈反彈，法務部正式發表國內第一步「檢察改革白皮書」，對於檢察官的定位，法務部仍堅持「司法官屬性」，反對司法院改革藍皮⋯⋯

根據司法院於1999年3月29日公布的司法改革措施中，決定於1999年底前，將刑事法庭上檢察官席位下移和辯護律師對等，引起檢察官不小爭議，不少檢察官認為尊嚴受損，已出現反彈聲浪。過去基於「使法庭民⋯⋯

司法審判公信力不彰，法官的自律不足都是使人民視法院如衙門。司法院長翁岳生於1999年3月29日公布的司法再造藍圖，將「法官」列為加強監督、改造的核心對象。司法改革藍圖指出，法官的改造、檢討加強法官⋯⋯