針對司法院日前公布的司法改革藍圖，法務部就其中刑事訴訟改採當事人進行主義、檢察官席位及司法官訓練所隸屬等三大問題，提出新聞稿回應，法務部認為法官仍應維持發現真實的義務，且檢察官席位應與律師而非被告⋯⋯

針對司法院擬具刑事訴訟制度改採當事人進行主義等司法改革藍圖，法務部於1999年3月31日也提出不同意見，認為刑事訴訟制度不應以當事人進行主義或職權進行主義的二分法來討論，應採加強檢察官舉證責任並維⋯⋯

針對司法院所提司法藍圖，規劃我國刑事訴訟將朝「當事人進行主義」方向修正，部分檢察官私下表示無法苟同，並強調外國的訴訟不能照單全收，應有相關配套措施，否則改革將不會成功。司法院提出司改藍圖及時間表後⋯⋯

1999年3月31日法務部提出首部檢察改革白皮書，法務部長葉金鳳表示，法務部將勇於面對司法改革，但司法改革必須要有配套，不能莽撞、不能有想像空間。由於法務部的改革方案與司法院目前提出的司改藍皮書有⋯⋯

1999年3月31日司法院秘書長楊仁壽在立法院司法委員會答詢時承諾，司法院的改革藍圖將盡全力進行，預計四年內將台灣建設成一個現代法治國家，未來司法院打算將檢察官在法庭的席位調整到與被告對等，這是基⋯⋯

司法院於1999年3月30日提出的司法改革藍皮書政策，3月31日立刻遭到法務部強烈反彈，法務部正式發表國內第一步「檢察改革白皮書」，對於檢察官的定位，法務部仍堅持「司法官屬性」，反對司法院改革藍皮⋯⋯

司法院長翁岳生於1999年3月30日公布司法再造藍圖，以「無罪推定理論」、「實質正當法律程序」為核心理念，期使法官能講求程序正義，發揮敬業態度及專業品質。藍圖共分「實現司法為民的理念」、「建立權責⋯⋯

根據司法院於1999年3月29日公布的司法改革措施中，決定於1999年底前，將刑事法庭上檢察官席位下移和辯護律師對等，引起檢察官不小爭議，不少檢察官認為尊嚴受損，已出現反彈聲浪。過去基於「使法庭民⋯⋯

為了推動建立公平正義的訴訟制度，司法院決定將現行的「職權調查主義」刑事訴訟制度，改採「當事人進行主義」，未來一旦修法，法官審判時只能聽訟。我國現行的刑事訴訟制度是採職權調查主義，法官對於檢察官起訴⋯⋯

1999年7月26日司法院召開記者會，公布依據全國司法改革會議獲致結論而訂定的具體措施及時間表，逐步落實司法改革會議結論，並將建立監督機制，邀集審、檢、學及社會賢達等各界代表組成委員會，持續監督全⋯⋯

議題包含「司法行政權的分配與歸屬」結論4點、「強化辯護人之功能」結論3點、「人民對司法審判之參與」結論1點、「推定民事事件審理集中化，強化第一審之事實審功能，使第一審成為事實審判中心」6點、「第三⋯⋯

包含「刑事訴訟制度之改革」15項提案、「刑事法庭席位之改造」1項提案、「強化檢察體系，提升犯罪偵查能力」4項提案，共3大議題，20項提案，針對議案進行討論，並紀錄討論結果。。(《自由時報》，199⋯⋯