包含1999年7月6日、7月7日、7月8日三日行程，每日均分為上、下午兩個場次，並進行分組會議討論。

1999年7月7日司法改革監督聯盟發表，報載法務部次長謝文定雨副司長蔡碧玉在全國司法改革會議第一天議程結束後被「請」到司法年院繼續挑燈夜戰，「協商」至晚間始「放人」，這樣的情節易受人聯想，司法改革⋯⋯

第一分組會議提案結論包含「進程在司法院內設各庭，遠程司法院僅由大法官組成」、「司法院設司法會議，為司法院長諮詢機關，促成司法政策與監督執行」、「增設無資力被告請求義務辯護制度、全國律師義務辯護輪值⋯⋯

第一分組會議提案結論包含「司法院審判機關化，掌理民、刑、行政訴訟、公務員懲戒、憲法解釋及政黨違憲解釋權」、「強化法律扶助，建立無資力被告得請求義務辯護」、「廢除公公設辯護人制度」等，共9點；第二分⋯⋯

議題包含「司法院定位」，結論2點、「落實人民訴訟權」，結論3點、「建立人民參審制度」，結論2點、「民事訴訟制度改革」，結論2點、「合議制度之落實」，結論2點、「刑事訴訟制度改革」結論12點、「法官⋯⋯

第一組達成協議共9點、第二組達成協議共10點、第三組達成協議共7點。第一組未達成協議共2點，包含「強化辯護人偵查中功能」、「設立檢察審查會監督檢察官」；第二組為達成協議共8點，包含「法院得依職權調⋯⋯

第一組議題討論「司法院定位」以及「人民得否合意選擇法官」，包含議案5案，前者初步結論採甲案為近程目標，丁案為遠程目標做為繼續研討及整合的基礎、後者將於1999年7月7日進行討論。第二組議題討論「刑⋯⋯

災變至今已2年，從中央到地方善後處理協商會議召開了近200次，始終沒有具體而有效的解決方式。目前唯一提出的「原地補強改善」主張，預估經費高達2億七千萬，且因在人文、環境心裡層面考量，及地質條件不合⋯⋯

由律師詹順貴提供，首先提出「智能障礙在刑法及民法上的意義」，區分刑法上心神喪失及精神耗弱間的關係，並針對民事訴訟上可否申請禁治產宣告進行補述，其後以「容易發生在智障者身上的法律問題」為主題，討論自⋯⋯

討論議案包含「一─一 司法院定位」提案2項、「一─二 建立辯護權為刑事被告基本人權之具體制度」提案2項、「一─三 研採建立人民參與司法審判之制度」提案3項、「一─四 民事訴訟制度之改革」提案3項、⋯⋯

改革目標包含「壹、確保獨立公正的司法」，以司法人事、行政制度民主化、建立完善的法官制度、司法應超然獨立出黨派之外、司法院預算獨立應予以入憲等為改革方向；「貳、強化保障民權的司法」，以加強大法官釋憲⋯⋯

由司法院編印，內容包含「迎接新世紀的挑戰 加速改革司法」共3頁、「實現司法為民的理念」共7頁、「建立權責相符的正確觀念」共7頁、「提供合理的審判環境」共7頁、「推動公平正義的訴訟制度」共9頁、「改⋯⋯