司法院於1999年3月29日公布司法改革藍圖的時程表，列出多項具體改革措施，理想性頗高，範圍也很廣，然而其中有許多並非新業，多承襲自司法院前院長施啟揚任內的政策，但在短期內並未見成效。此次司法改革⋯⋯

法務部於1999年3月31日上午推出有史以來第一份「檢察改革白皮書」，法務部長葉金鳳表示，這份白皮書是以「人民的司法」作為改革的主軸。對於外界認為應採取的「起訴狀一本主義」，法務部在白皮書中不表贊⋯⋯

法務部於1999年3月31日提出「檢察白皮書」內容大談檢察改革方向，檢察官改革協會發起人之一的士林地檢署檢察官陳瑞仁表示，白皮書提示的成立檢察官會議、研修法官法草案及落實檢察長評鑑等，大方向值得肯⋯⋯

法務部於1999年3月31日公布首部「檢察改革白皮書」，希望讓全民共同來體檢司法，參與司法，建構合理行使檢察職權刑事訴訟制度，推動提升到刑事司法效率的刑事政策；並主張研究採行審判的國民監督制度，及⋯⋯

司法院提出司法改革藍圖，未來刑事訴訟將採當事人進行主義，並指名司法改革取向將以人民為主體。但法界人士直言，大部份民眾對於司法改革的認知，與司法院仍有一段距離。司法院司法改革藍圖中有關刑事訴訟將採當⋯⋯

1999年3月31日法務部提出「檢改白皮書」，建議刑事訴訟法修正不要陷入「職權主義」或「當事人進行主義」的迷思。法務部長葉金鳳認為，法務部不是站在本位主義，而是希望要有一套完整的配套措施，希望外界⋯⋯

針對司法院日前公布的司法改革藍圖，法務部就其中刑事訴訟改採當事人進行主義、檢察官席位及司法官訓練所隸屬等三大問題，提出新聞稿回應，法務部認為法官仍應維持發現真實的義務，且檢察官席位應與律師而非被告⋯⋯

針對司法院所提司法藍圖，規劃我國刑事訴訟將朝「當事人進行主義」方向修正，部分檢察官私下表示無法苟同，並強調外國的訴訟不能照單全收，應有相關配套措施，否則改革將不會成功。司法院提出司改藍圖及時間表後⋯⋯

1999年3月31日法務部提出首部檢察改革白皮書，法務部長葉金鳳表示，法務部將勇於面對司法改革，但司法改革必須要有配套，不能莽撞、不能有想像空間。由於法務部的改革方案與司法院目前提出的司改藍皮書有⋯⋯

司法院公布司法改革藍圖，立即引發法務部系統的反彈，究竟是司法院版本還是法務部的檢察改革白皮書行的通，見仁見智，兩者皆為司法機關，應該是緊密的合作關係，司法院身為最高司法行政機關，理當扛起司法改革的⋯⋯

1999年7月26日司法院公布「全國司法改革會議結論具體措施暨時間表」，然而同時，許多法官卻因不滿司法院管考新措施，士氣普遍低落，甚至有資深法官私下流傳似「黑函」的文章，嚴厲批評司法高層，並表示司⋯⋯

新竹地檢署檢察官激烈地反彈司法院最新的司改藍圖，表示無法接受完全未與檢方協商，即自居司法改革者，在檢察官人力、物力嚴重缺乏且沒有任何具體配套措施下，如此作法無異本末倒置，未來檢察官勢成司法體系中最⋯⋯