提案明定各級法院檢察署之預算應獨立編製，檢察總長須由立法機關行使同意權後任用，各級法院檢察署檢察長亦由檢察總長任命，以維檢察機關獨立辦案之立場；另擬將高等法院檢察署任務編組之特偵組予以法制化，於高⋯⋯

提案明確區隔檢察總長負責個案正義、法務部長負責通案檢察政策之職權分際，檢察總長須由立法院行使同意權後任用；另擬將高等法院檢察署任務編組之特偵組予以法制化，於最高法院檢察署設置特別偵查處，以提升偵查⋯⋯

修正草案的對照條文有第59條之1、第62條、第63條之1、第66條、第111條。（《立法院議案關係文書》，院總第647號，委員提案第6187號）