司改會發表民間版一九九九憲法增修條文草案總說明，並針對司法制度與刑事人權部分提出相關說明與修正條文。（《司法改革雜誌》，第22期，1999年8月15日，頁16-17。）

臺灣人權促進會於參酌國際人權法相關規範後，重新審視臺灣所施行之刑事訴訟，並提出相關建言，分別從羈押、律師權、就醫權、無罪推定原則、刑求、傳喚與詰問證人等面向予以陳述。

2005年11月1日司改會新憲小組由吳志光教授擔任召集人，討論2006年臺灣修新憲案—司法制度改革，以及司法院定位等相關問題。

司改會針對司法院組織法之相關問題與立法方向提出建言與主張，並說明該會立場與實際行動為何。

2005年3月司法院秘書長范光群於立法院第六屆第一會期司法委員會就司法院大法官審理案件法修正草案、刑事訴訟法部分條文修正草案、冤獄賠償法修正草案、行政訴訟法部分條文修正草案、行政訴訟法施行法修正草⋯⋯