陳定南因大幅調整檢察首長人事，引發部分基層檢察官的抵制，4月20日司改會發表聲明表示，檢察官的反彈訴求「不應以公眾利益為祭品」。（《自由時報》，2001年4月21日，第2版）

2001年4月21日法務部長陳定南調動21名檢察首長，引發部分檢察官抵制辦案，司改會發表四點聲明：一、職務調動屬於部長權限，亦將由部長負擔政治後果；二、職務調動與檢察外部獨立不相干；三、檢討檢察官⋯⋯

2001年5月17日上午司改會就陳水扁競選總統時提出「司法政策白皮書」21項司法改革訴求予以評鑑，結論是只有33.5分，僅法務部長陳定南交出亮麗的成績單，起訴164位民代，肅貪金額較前年增加四倍餘⋯⋯

2001年5月17日司改會就陳水扁提出「廿項司法政策」進行評鑑，除推動國民參審及掃黑肅貪、廢除法官考試等評比較高外，其餘分數均未過半，司法政策總成績僅得33.5分；司改會同時建議政府加強警政改革，⋯⋯

由董某冤獄乙案，討論檢察官執行羈押之要件與必要性，及是否應限縮、節制、監督其強制處分權之行使，以維持權力平衡機制之有效運作。

總統陳水扁與法務部長陳定南提出設立廉政總署的構想，因組織是由原情治機關調查局廉政和法務部政風司合併設立，並賦予「強制處分權」，因此令作者感到擔憂。（《自由時報》，2000年4月25日）