真調會發言人王清峰表示，在釋憲結果公布前，為減少爭議，真調會將「節制行使職權」。目前真調會已初步在台北市找好辦公室，涉及機密文件與證物的保存，保全系統受到注目。有關真調會未來是否借調檢察官協助辦案⋯⋯

2004年10月6日《中國時報》報導，親民黨在程委會提出三一九真調會條例修正案，在國親陣營合作下，封殺民進黨要求的併案審查，順利排入立院院會議程。民進黨批評泛藍的修法案僅修五項條文，其餘條文違憲內⋯⋯

2004年10月6日《中國時報》報導指出，在資深法官眼中，真調條例有違憲之虞的條文很多，嚴重侵害法官的審判獨立權、被告甚至證人憲法基本人權中的緘默權。因真調會行使職權不受刑事訴訟法限制，其強制處分⋯⋯

郭榮顯於2004年10月10日發文向真調會陳情，以避免損害人民所擁有中華民國在台灣的主權利益為由，指真調會無行使職權之適合性、必要性和合比例性，建請真調會立即停止運作。

2004年10月5日《聯合報》報導，澄社、檢改會、台灣法學會、全聯會、台權會等民間團體共同組成「民間監督真相調查委員會聯盟」，將從民間的角度監督真調會，呼籲民眾注意避免自己憲法上的權益遭受損害，希⋯⋯

2004年10月5日《中國時報》報導，澄社、台灣法學會、台權會、檢改會、全聯會等民間團體為監督「三一九槍擊事件真相調查特別委員會」，宣布組成「民間監督真相調查委員會聯盟」，希望大法官會議盡快就真調⋯⋯

319槍擊案真相調查委員會成立運作後，產生不少關於偵辦資料及案件移交的問題。（《聯合報》，2004年10月5日）

前一日真相調查委員會首度開會，真調會委員、前警政署副署長余玉堂卻未出席，使得真調會差點因委員數未過半而流會。余玉堂原為親民黨屬意人選，但他臨時退出真調會的舉動，藍營內部議論紛紛，有人認為是由於警界⋯⋯

真調會於昨日召開首次會議，選施啟揚任召集委員，民進黨立委則於立法院真調會場外舉牌抗議。施啟揚強調，真調會條例違憲與否有待大法官解釋，但會將「不必要的條文暫不行使」，並建議立法院修法化解社會疑慮。親⋯⋯

台南檢警單位組成的0319專案小組已備妥相關資料等待移交真調會；專案小組多數成員期待退出真調會的運作，且認為調查不應圍繞在政治動機論。（《聯合報》，2004年10月4日）

2004年10月4日《聯合報》新聞。行政院發言人陳其邁指出，真調費經費須詳列預算需求及目標，以免違反預算法、決算法與審計法等。

2004年10月6日《中國時報》報導，行政院長游錫堃於立法院備詢時表示，真調會一切經費支出必須符合預算法規定，既然真調會召集委員都主張部分條例內容應該修法，更加證明條例違憲，行政院覆議案有正當性。