司改會發表民間版一九九九憲法增修條文草案總說明，並針對司法制度與刑事人權部分提出相關說明與修正條文。〈民間版一九九九年憲法增修條文意見〉（《司法改革雜誌》，1999年8月15日，第22期。）

臺灣人權促進會於參酌國際人權法相關規範後，重新審視臺灣所施行之刑事訴訟，並提出相關建言，分別從羈押、律師權、就醫權、無罪推定原則、刑求、傳喚與詰問證人等面向予以陳述。